Админ, Тарас, большое спасибо за столь скорый ответ.
Входы закорачивал, но не все, а только те, которые регистрировались. Попробую закоротить все.
Да, ТС подключено напрямую. Но в любом случае получается явно не то, что можно ожидать:
Расшифровка нумерации:
1 - Включение Генератора 1 (питание ТС)
2 - Пауза регистрации (около 2-3 мин)
3 - ТС помещено в горячую воду
4 - ТС помещено в холодную воду
Итак, до включения генератора все каналы показывают одинаковые значения. После включения (1) они "расходятся" как было описано в первом сообщении.
Самое странное, что ТС подключено к 8-му каналу, который в ходе измерений вообще не меняет показания. После погружения ТС в горячую, а затем в холодную воду (3, 4) начинают меняться показания по каналам 3, 7, 11, 15 
Расшифровка нумерации:
1 - Включение Генератора 1 (питание ТС)
2 - Пауза регистрации (около 2-3 мин)
3 - ТС помещено в горячую воду
4 - ТС помещено в холодную воду
Итак, до включения генератора все каналы показывают одинаковые значения. После включения (1) они "расходятся" как было описано в первом сообщении.
Самое странное, что ТС подключено к 8-му каналу, который в ходе измерений вообще не меняет показания. После погружения ТС в горячую, а затем в холодную воду (3, 4) начинают меняться показания по каналам 3, 7, 11, 15 
1 деление - 0,1 мВ
1 канал (красный) - искусственно запитан от генератора (0,05 В).
2 канала отреагировали на это - 3-й (синий) и 8-й (голубой)
2 канала не отреагировали - 9-й (малиновый) и 4-й (салатовый).
Повышение на 8-м примерно соответствует 40-60 градусам Цельсия (подключено термосопротивление).
Это неисправность? Что делать?
Ответьте по возможности как можно скорее. Заранее премного благодарен за любую помощь.
UPDATE: происходит что-то явно странное.
До включения "Генератора 1" все 16 каналов находятся на одной линии (к ним ничего не подключено) - около 0,45 мВ.
После включения "Генератора 1":
- 4 канала показывают 4,8 мВ
- 4 канала показывают 1 мВ
- 7 каналов показывают 0,8 мВ
- 1 канал показывает 0,7 мВ
Далее, к одному каналу подключил термосопротивление. Окунаю его в горячую и холодную воду. И наблюдаю изменение напряжения по 3 каналам одновременно!